Hasta la fecha, la Cámara de Cuentas está configurada, según el Título IV de su ley de creación, por los siguientes órganos:
La primera designación de Consejeros de la Cámara de Cuentas de la Comunidad de Madrid se celebró en sesión de la Asamblea de Madrid de 14 de diciembre de 2000, produciéndose su renovación sucesiva, cada seis años.
Con la entrada en vigor de la Ley 9/2019, de 10 abril, de modificación de la Ley 11/1999, de 29 de abril, de la Cámara de Cuentas de la Comunidad de Madrid, se han operado importantes cambios en la organización de la Cámara, pendientes de materializarse. La nueva norma prevé un cambio en la estructura del Consejo, que pasa de siete a tres Consejeros, uno de los cuales será el Presidente.
Organización Interna